TY - JOUR AU - Saathoff, E. AU - Pritsch, M. AU - Geldmacher, C. AU - Hoffmann, O. AU - Koehler, R. N. AU - Maboko, L. AU - Maganga, L. AU - Geis, S. AU - McCutchan, F. E. AU - Kijak, G. H. PY - 2010 DA - 2010// TI - Viral and host factors associated with the hiv-1 viral load setpoint in adults from Mbeya region, Tanzania JO - JAIDS Journal of Acquired Immune Deficiency Syndromes VL - 54 UR - https://doi.org/10.1097/QAI.0b013e3181cf30ba DO - 10.1097/QAI.0b013e3181cf30ba ID - Saathoff2010 ER - TY - JOUR AU - Perelson, A. AU - Neumann, A. AU - Markowitz, M. PY - 1996 DA - 1996// TI - HIV-1 dynamics in vivo: virion clearance rate, infected cell life-span, and viral generation time JO - Science VL - 271 UR - https://doi.org/10.1126/science.271.5255.1582 DO - 10.1126/science.271.5255.1582 ID - Perelson1996 ER - TY - JOUR AU - Geretti, A. M. PY - 2006 DA - 2006// TI - HIV-1 subtypes: epidemiology and significance fov HIV management JO - Current Opinion in Infectious Diseases VL - 19 UR - https://doi.org/10.1097/01.qco.0000200293.45532.68 DO - 10.1097/01.qco.0000200293.45532.68 ID - Geretti2006 ER - TY - JOUR AU - Bonhoeffer, S. AU - Funk, G. A. AU - Günthard, H. F. AU - Fischer, M. AU - Müller, V. PY - 2003 DA - 2003// TI - Glancing behind virus load variation in HIV-1 infection JO - Trends in microbiology VL - 11 UR - https://doi.org/10.1016/j.tim.2003.09.002 DO - 10.1016/j.tim.2003.09.002 ID - Bonhoeffer2003 ER - TY - JOUR AU - Fellay, J. AU - Shianna, K. V. AU - Ge, D. AU - Colombo, S. AU - Ledergerber, B. AU - Weale, M. AU - Zhang, K. AU - Gumbs, C. AU - Castagna, A. AU - Cossarizza, A. PY - 2007 DA - 2007// TI - A whole-genome association study of major determinants for host control of HIV-1 JO - Science VL - 317 UR - https://doi.org/10.1126/science.1143767 DO - 10.1126/science.1143767 ID - Fellay2007 ER - TY - JOUR AU - Fellay, J. AU - Ge, D. AU - Shianna, K. V. AU - Colombo, S. AU - Ledergerber, B. AU - Cirulli, E. T. AU - Urban, T. J. AU - Zhang, K. AU - Gumbs, C. E. AU - Smith, J. P. PY - 2009 DA - 2009// TI - Common genetic variation and the control of HIV-1 in humans JO - PLoS Genet VL - 5 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1000791 DO - 10.1371/journal.pgen.1000791 ID - Fellay2009 ER - TY - JOUR AU - Hogan, C. M. AU - Hammer, S. M. PY - 2001 DA - 2001// TI - Host determinants in HIV infection and disease: part 2: genetic factors and implications for antiretroviral therapeutics JO - Annals of Internal Medicine VL - 134 UR - https://doi.org/10.7326/0003-4819-134-10-200105150-00012 DO - 10.7326/0003-4819-134-10-200105150-00012 ID - Hogan2001 ER - TY - JOUR AU - Åsjö, B. AU - Albert, J. AU - Karlsson, A. AU - Morfeldt-Månson, L. AU - Biberfeld, G. AU - Lidman, K. AU - Fenyö, E. PY - 1986 DA - 1986// TI - Replicative capacity of human immunodeficiency virus from patients with varying severity of hiv infection JO - The Lancet VL - 328 UR - https://doi.org/10.1016/S0140-6736(86)90169-8 DO - 10.1016/S0140-6736(86)90169-8 ID - Åsjö1986 ER - TY - JOUR AU - Ayele, W. AU - Mekonnen, Y. AU - Messele, T. AU - Mengistu, Y. AU - Tsegaye, A. AU - Bakker, M. AU - Berkhout, B. AU - Dorigo-Zetsma, W. AU - Wolday, D. AU - Goudsmit, J. PY - 2010 DA - 2010// TI - Differences in HIV type 1 RNA plasma load profile of closely related cocirculating Ethiopian subtype C strains: C and C' JO - AIDS Res Hum Retroviruses VL - 26 UR - https://doi.org/10.1089/aid.2009.0152 DO - 10.1089/aid.2009.0152 ID - Ayele2010 ER - TY - JOUR AU - Betts, M. R. AU - Ambrozak, D. R. AU - Douek, D. C. AU - Bonhoeffer, S. AU - Brenchley, J. M. AU - Casazza, J. P. AU - Koup, R. A. AU - Picker, L. J. PY - 2001 DA - 2001// TI - Analysis of total human immunodeficiency virus (HIV)-specific CD4+ and CD8+ T-Cell responses: relationship to viral load in untreated HIV infection JO - J Virol VL - 75 UR - https://doi.org/10.1128/JVI.75.24.11983-11991.2001 DO - 10.1128/JVI.75.24.11983-11991.2001 ID - Betts2001 ER - TY - JOUR AU - Blaak, H. AU - Brouwer, M. AU - Ran, L. J. AU - de Wolf, F. AU - Schuitemaker, H. PY - 1998 DA - 1998// TI - In vitro replication kinetics of human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1) variants in relation to virus load in long-term survivors of HIV-1 infection JO - Journal of Infectious Diseases VL - 177 UR - https://doi.org/10.1086/514219 DO - 10.1086/514219 ID - Blaak1998 ER - TY - JOUR AU - Hu, D. J. AU - Vanichseni, S. AU - Mastro, T. D. AU - Raktham, S. AU - Young, N. L. AU - Mock, P. A. AU - Subbarao, S. AU - Parekh, B. S. AU - Srisuwanvilai, L. AU - Sutthent, R. PY - 2001 DA - 2001// TI - Viral load differences in early infection with two HIV-1 subtypes JO - AIDS VL - 15 UR - https://doi.org/10.1097/00002030-200104130-00003 DO - 10.1097/00002030-200104130-00003 ID - Hu2001 ER - TY - JOUR AU - Kivelä, P. S. AU - Krol, A. AU - Salminen, M. O. AU - Geskus, R. B. AU - Suni, J. I. AU - Anttila, V. -. J. AU - Liitsola, K. AU - Zetterberg, V. AU - Miedema, F. AU - Berkhout, B. PY - 2005 DA - 2005// TI - High plasma HIV load in the CRF01-AE outbreak among injecting drug users in Finland JO - Scandinavian Journal of Infectious Diseases VL - 37 UR - https://doi.org/10.1080/00365540410021054 DO - 10.1080/00365540410021054 ID - Kivelä2005 ER - TY - JOUR AU - Hollingsworth, T. D. AU - Laeyendecker, O. AU - Shirreff, G. AU - Donnelly, C. A. AU - Serwadda, D. AU - Wawer, M. J. AU - Kiwanuka, N. AU - Nalugoda, F. AU - Collinson-Streng, A. AU - Ssempijja, V. PY - 2010 DA - 2010// TI - HIV-1 transmitting couples have similar viral load set-points in Rakai, Uganda JO - Plos Pathog VL - 6 UR - https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1000876 DO - 10.1371/journal.ppat.1000876 ID - Hollingsworth2010 ER - TY - JOUR AU - Alizon, S. AU - von Wyl, V. AU - Stadler, T. AU - Kouyos, R. D. AU - Yerly, S. AU - Hirschel, B. AU - Boni, J. AU - Shah, C. AU - Klimkait, T. AU - Furrer, H. PY - 2010 DA - 2010// TI - Phylogenetic approach reveals that virus genotype largely determines HIV set-point viral load JO - Plos Pathog VL - 6 UR - https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1001123 DO - 10.1371/journal.ppat.1001123 ID - Alizon2010 ER - TY - JOUR AU - Fraser, C. AU - Hollingsworth, T. D. PY - 2010 DA - 2010// TI - Interpretation of correlations in setpoint viral load in transmitting couples JO - AIDS VL - 24 UR - https://doi.org/10.1097/QAD.0b013e32833e7a64 DO - 10.1097/QAD.0b013e32833e7a64 ID - Fraser2010 ER - TY - JOUR AU - Hecht, F. M. AU - Hartogensis, W. AU - Bragg, L. AU - Bacchetti, P. AU - Atchison, R. AU - Grant, R. AU - Barbour, J. AU - Deeks, S. G. PY - 2010 DA - 2010// TI - HIV RNA level in early infection is predicted by viral load in the transmission source JO - AIDS VL - 24 UR - https://doi.org/10.1097/QAD.0b013e328337b12e DO - 10.1097/QAD.0b013e328337b12e ID - Hecht2010 ER - TY - JOUR AU - Muller, V. AU - Fraser, C. AU - Herbeck, J. T. PY - 2011 DA - 2011// TI - A strong case for viral genetic factors in HIV virulence JO - Viruses VL - 3 UR - https://doi.org/10.3390/v3030204 DO - 10.3390/v3030204 ID - Muller2011 ER - TY - JOUR AU - Kouyos, R. D. AU - von Wyl, V. AU - Hinkley, T. AU - Petropoulos, C. J. AU - Haddad, M. AU - Whitcomb, J. M. AU - Boni, J. AU - Yerly, S. AU - Cellerai, C. AU - Klimkait, T. PY - 2011 DA - 2011// TI - Assessing predicted HIV-1 replicative capacity in a clinical setting JO - Plos Pathog VL - 7 UR - https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1002321 DO - 10.1371/journal.ppat.1002321 ID - Kouyos2011 ER - TY - JOUR AU - Hinkley, T. AU - Martins, J. AU - Chappey, C. AU - Haddad, M. AU - Stawiski, E. AU - Whitcomb, J. M. AU - Petropoulos, C. J. AU - Bonhoeffer, S. PY - 2011 DA - 2011// TI - A systems analysis of mutational effects in HIV-1 protease and reverse transcriptase JO - Nat Genet VL - 43 UR - https://doi.org/10.1038/ng.795 DO - 10.1038/ng.795 ID - Hinkley2011 ER - TY - JOUR AU - Attia, S. AU - Egger, M. AU - Müller, M. AU - Zwahlen, M. AU - Low, N. PY - 2009 DA - 2009// TI - Sexual transmission of HIV according to viral load and antiretroviral therapy: systematic review and meta-analysis JO - AIDS VL - 23 UR - https://doi.org/10.1097/QAD.0b013e32832b7dca DO - 10.1097/QAD.0b013e32832b7dca ID - Attia2009 ER - TY - JOUR AU - Baeten, J. M. AU - Kahle, E. AU - Lingappa, J. R. AU - Coombs, R. W. AU - Delany-Moretlwe, S. AU - Nakku-Joloba, E. AU - Mugo, N. R. AU - Wald, A. AU - Corey, L. AU - Donnell, D. PY - 2011 DA - 2011// TI - Genital HIV-1 RNA predicts risk of heterosexual HIV-1 transmission JO - Science Translational Medicine VL - 3 UR - https://doi.org/10.1126/scitranslmed.3001888 DO - 10.1126/scitranslmed.3001888 ID - Baeten2011 ER - TY - JOUR AU - Quinn, T. C. AU - Wawer, M. J. AU - Sewankambo, N. AU - Serwadda, D. AU - LI, C. AU - Wabwire-Mangen, F. AU - Meehan, M. O. AU - Lutalo, T. AU - Gray, R. H. PY - 2000 DA - 2000// TI - Viral load and heterosexual transmission of human immunodeficiency virus type 1 JO - New England Journal of Medicine VL - 342 UR - https://doi.org/10.1056/NEJM200003303421303 DO - 10.1056/NEJM200003303421303 ID - Quinn2000 ER - TY - JOUR AU - Wilson, D. P. AU - Law, M. G. AU - Grulich, A. E. AU - Cooper, D. A. AU - Kaldor, J. M. PY - 2008 DA - 2008// TI - Relation between HIV viral load and infectiousness: a model-based analysis JO - Lancet VL - 372 UR - https://doi.org/10.1016/S0140-6736(08)61115-0 DO - 10.1016/S0140-6736(08)61115-0 ID - Wilson2008 ER - TY - JOUR AU - Hollingsworth, T. D. AU - Anderson, R. M. AU - Fraser, C. PY - 2008 DA - 2008// TI - HIV-1 transmission, by stage of infection JO - Journal of Infectious Diseases VL - 198 UR - https://doi.org/10.1086/590501 DO - 10.1086/590501 ID - Hollingsworth2008 ER - TY - JOUR AU - McLean, A. R. AU - Nowak, M. A. PY - 1992 DA - 1992// TI - Models of interactions between hiv and other pathogens JO - Journal of Theoretical Biology VL - 155 UR - https://doi.org/10.1016/S0022-5193(05)80549-1 DO - 10.1016/S0022-5193(05)80549-1 ID - McLean1992 ER - TY - JOUR AU - Modjarrad, K. AU - Vermund, S. H. PY - 2010 DA - 2010// TI - Effect of treating co-infections on HIV-1 viral load: a systematic review JO - Lancet Infectious Diseases VL - 10 UR - https://doi.org/10.1016/S1473-3099(10)70093-1 DO - 10.1016/S1473-3099(10)70093-1 ID - Modjarrad2010 ER - TY - JOUR AU - Modjarrad, K. AU - Chamot, E. AU - Vermund, S. PY - 2008 DA - 2008// TI - Impact of small reductions in plasma HIV RNA levels on the risk of heterosexual transmission and disease progression JO - AIDS VL - 22 UR - https://doi.org/10.1097/QAD.0b013e328312c756 DO - 10.1097/QAD.0b013e328312c756 ID - Modjarrad2008 ER - TY - JOUR AU - Barnabas, R. V. AU - Webb, E. L. AU - Weiss, H. A. AU - Wasserheit, J. N. PY - 2011 DA - 2011// TI - The role of coinfections in HIV epidemic trajectory and positive prevention: a systematic review and meta-analysis JO - AIDS VL - 25 UR - https://doi.org/10.1097/QAD.0b013e3283491e3e DO - 10.1097/QAD.0b013e3283491e3e ID - Barnabas2011 ER - TY - JOUR AU - Bentwich, Z. AU - Kalinkovich, A. AU - Weisman, Z. PY - 1995 DA - 1995// TI - Immune activation is a dominant factor in the pathogenesis of african AIDS JO - Immunology Today VL - 16 UR - https://doi.org/10.1016/0167-5699(95)80119-7 DO - 10.1016/0167-5699(95)80119-7 ID - Bentwich1995 ER - TY - JOUR AU - Lawn, S. PY - 2004 DA - 2004// TI - AIDS in Africa: the impact of coinfections on the pathogenesis of HIV-1 infection JO - Journal of Infection VL - 48 UR - https://doi.org/10.1016/j.jinf.2003.09.001 DO - 10.1016/j.jinf.2003.09.001 ID - Lawn2004 ER - TY - JOUR AU - Kublin, J. G. AU - Patnaik, P. AU - Jere, C. S. AU - Miller, W. C. AU - Hoffman, I. F. AU - Chimbiya, N. AU - Pendame, R. AU - Taylor, T. E. AU - Molyneux, M. E. PY - 2005 DA - 2005// TI - Effect of Plasmodium falciparum malaria on concentration of HIV-1-RNA in the blood of adults in rural Malawi: a prospective cohort study JO - Lancet VL - 365 ID - Kublin2005 ER - TY - JOUR AU - Ostrowski, M. A. AU - Krakauer, D. C. AU - LI, Y. AU - Justement, S. J. AU - Learn, G. AU - Ehler, L. A. AU - Stanley, S. K. AU - Nowak, M. AU - Fauci, A. S. PY - 1998 DA - 1998// TI - Effect of immune activation on the dynamics of human immunodeficiency virus replication and on the distribution of viral quasispecies JO - Journal of Virology VL - 72 ID - Ostrowski1998 ER - TY - JOUR AU - Rosok, B. AU - Voltersvik, P. AU - Bjerknes, R. AU - Axelsson, M. AU - Haaheim, L. R. AU - Asjo, B. PY - 1996 DA - 1996// TI - Dynamics of HIV-1 replication following influenza vaccination of HIV + individuals JO - Clin Exp Immunol VL - 104 UR - https://doi.org/10.1046/j.1365-2249.1996.25732.x DO - 10.1046/j.1365-2249.1996.25732.x ID - Rosok1996 ER - TY - JOUR AU - Brunham, R. C. AU - Plummer, F. A. PY - 1990 DA - 1990// TI - A general model of sexually transmitted disease epidemiology and its implications for control JO - Med Clin North Am VL - 74 ID - Brunham1990 ER - TY - JOUR AU - Abu-Raddad, L. J. AU - Magaret, A. S. AU - Celum, C. AU - Wald, A. AU - Longini, I. M. AU - Self, S. G. AU - Corey, L. PY - 2008 DA - 2008// TI - Genital herpes has played a more important role than any other sexually transmitted infection in driving HIV prevalence in Africa JO - PLoS One VL - 3 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pone.0002230 DO - 10.1371/journal.pone.0002230 ID - Abu-Raddad2008 ER - TY - JOUR AU - Cuadros, D. AU - Crowley, P. AU - Augustine, B. AU - Stewart, S. AU - Garcia-Ramos, G. PY - 2011 DA - 2011// TI - Effect of variable transmission rate on the dynamics of HIV in sub-Saharan Africa JO - BMC Infectious Diseases VL - 11 UR - https://doi.org/10.1186/1471-2334-11-216 DO - 10.1186/1471-2334-11-216 ID - Cuadros2011 ER - TY - JOUR AU - Callaway, D. AU - Perelson, A. PY - 2002 DA - 2002// TI - HIV-1 infection and low steady state viral loads JO - Bulletin of Mathematical Biology VL - 64 UR - https://doi.org/10.1006/bulm.2001.0266 DO - 10.1006/bulm.2001.0266 ID - Callaway2002 ER - TY - JOUR AU - Stafford, M. A. AU - Corey, L. AU - Cao, Y. AU - Daar, E. S. AU - Ho, D. D. AU - Perelson, A. S. PY - 2000 DA - 2000// TI - Modeling plasma virus concentration during primary HIV infection JO - Journal of Theoretical Biology VL - 203 UR - https://doi.org/10.1006/jtbi.2000.1076 DO - 10.1006/jtbi.2000.1076 ID - Stafford2000 ER - TY - BOOK AU - Nowak, M. AU - May, R. M. PY - 2000 DA - 2000// TI - Virus dynamics. Mathematical principles of immunology and virology PB - Oxford University Press CY - New York ID - Nowak2000 ER - TY - JOUR AU - Chen, X. AU - Xiao, B. AU - Shi, W. AU - Xu, H. AU - Gao, K. AU - Rao, J. AU - Zhang, Z. PY - 2003 DA - 2003// TI - Impact of acute vivax malaria on the immune system and viral load of HIV-positive subjects JO - Chin Med J (Engl) VL - 116 ID - Chen2003 ER - TY - JOUR AU - Hoffman, I. F. AU - Jere, C. S. AU - Taylor, T. E. AU - Munthali, P. AU - Dyer, J. R. AU - Wirima, J. J. AU - Rogerson, S. J. AU - Kumwenda, N. AU - Eron, J. J. AU - Fiscus, S. A. PY - 1999 DA - 1999// TI - The effect of Plasmodium falciparum malaria on HIV-1 RNA blood plasma concentration JO - AIDS VL - 13 UR - https://doi.org/10.1097/00002030-199903110-00007 DO - 10.1097/00002030-199903110-00007 ID - Hoffman1999 ER - TY - JOUR AU - Cuadros, D. F. AU - Branscum, A. J. AU - Crowley, P. H. PY - 2011 DA - 2011// TI - HIV-malaria co-infection: effects of malaria on the prevalence of HIV in East sub-Saharan Africa JO - International Journal of Epidemiology VL - 40 UR - https://doi.org/10.1093/ije/dyq256 DO - 10.1093/ije/dyq256 ID - Cuadros2011 ER - TY - JOUR AU - Hellriegel, B. PY - 1992 DA - 1992// TI - Modeling the immune-response to malaria with ecological concepts - short-term behavior against long-term equilibrium JO - P Roy Soc Lond B Bio VL - 250 UR - https://doi.org/10.1098/rspb.1992.0156 DO - 10.1098/rspb.1992.0156 ID - Hellriegel1992 ER - TY - JOUR AU - Malaguarnera, L. AU - Musumeci, S. PY - 2002 DA - 2002// TI - The immune response to Plasmodium falciparum malaria JO - The Lancet Infectious Diseases VL - 2 UR - https://doi.org/10.1016/S1473-3099(02)00344-4 DO - 10.1016/S1473-3099(02)00344-4 ID - Malaguarnera2002 ER - TY - JOUR AU - Anderson, R. M. AU - May, R. M. AU - Gupta, S. PY - 1989 DA - 1989// TI - Non-linear phenomena in host--parasite interactions JO - Parasitology VL - 99 UR - https://doi.org/10.1017/S0031182000083426 DO - 10.1017/S0031182000083426 ID - Anderson1989 ER - TY - JOUR AU - Hellriegel, B. PY - 1992 DA - 1992// TI - Modelling the immune response to malaria with ecological concepts: short-term behaviour against long-term equilibrium JO - Proceedings of the Royal Society of London Series B: Biological Sciences VL - 250 UR - https://doi.org/10.1098/rspb.1992.0156 DO - 10.1098/rspb.1992.0156 ID - Hellriegel1992 ER - TY - JOUR AU - Mideo, N. AU - Day, T. AU - Read, A. F. PY - 2008 DA - 2008// TI - Modelling malaria pathogenesis JO - Cellular Microbiology VL - 10 UR - https://doi.org/10.1111/j.1462-5822.2008.01208.x DO - 10.1111/j.1462-5822.2008.01208.x ID - Mideo2008 ER - TY - JOUR AU - Tumwiine, J. AU - Mugisha, J. Y. T. AU - Luboobi, L. S. PY - 2008 DA - 2008// TI - On global stability of the intra-host dynamics of malaria and the immune system JO - Journal of Mathematical Analysis and Applications VL - 341 UR - https://doi.org/10.1016/j.jmaa.2007.10.035 DO - 10.1016/j.jmaa.2007.10.035 ID - Tumwiine2008 ER - TY - JOUR AU - Thibodeaux, J. PY - 2010 DA - 2010// TI - Modeling erythropoiesis subject to malaria infection JO - Mathematical Biosciences VL - 225 UR - https://doi.org/10.1016/j.mbs.2010.02.001 DO - 10.1016/j.mbs.2010.02.001 ID - Thibodeaux2010 ER - TY - JOUR AU - Mideo, N. AU - Alizon, S. AU - Day, T. PY - 2008 DA - 2008// TI - Linking within- and between-host dynamics in the evolutionary epidemiology of infectious diseases JO - Trends in ecology & evolution (Personal edtion) VL - 23 UR - https://doi.org/10.1016/j.tree.2008.05.009 DO - 10.1016/j.tree.2008.05.009 ID - Mideo2008 ER - TY - JOUR AU - Obrien, W. A. AU - Grovitferbas, K. AU - Namazi, A. AU - Ovcakderzic, S. AU - Wang, H. J. AU - Park, J. AU - Yeramian, C. AU - Mao, S. H. AU - Zack, J. A. PY - 1995 DA - 1995// TI - Human immunodeficiency virus-type-1 replication can be increased in peripheral-blood of seropositive patients after influenza vaccination JO - Blood VL - 86 ID - Obrien1995 ER - TY - JOUR AU - Staprans, S. I. AU - Hamilton, B. L. AU - Follansbee, S. E. AU - Elbeik, T. AU - Barbosa, P. AU - Grant, R. M. AU - Feinberg, M. B. PY - 1995 DA - 1995// TI - Activation of virus replication after vaccination of HIV-1-infected individuals JO - J Exp Med VL - 182 UR - https://doi.org/10.1084/jem.182.6.1727 DO - 10.1084/jem.182.6.1727 ID - Staprans1995 ER - TY - JOUR AU - Cheynier, R. AU - Henrichwark, S. AU - Hadida, F. AU - Pelletier, E. AU - Oksenhendler, E. AU - Autran, B. AU - Wainhobson, S. PY - 1994 DA - 1994// TI - Hiv and T-Cell expansion in splenic white pulps is accompanied by infiltration of HIV-specific cytotoxic t-lymphocytes JO - Cell VL - 78 UR - https://doi.org/10.1016/0092-8674(94)90417-0 DO - 10.1016/0092-8674(94)90417-0 ID - Cheynier1994 ER - TY - JOUR AU - Xiao, L. AU - Owen, S. AU - Rudolph, D. AU - Lal, R. AU - Lal, A. PY - 1998 DA - 1998// TI - Plasmodium falciparum antigen induced human inmmunodeficiency virus type I replication is mediated trhough induction of tumor necrosis factor JO - The Journal of Infectious Diseases VL - 117 UR - https://doi.org/10.1086/514212 DO - 10.1086/514212 ID - Xiao1998 ER - TY - JOUR AU - Jones, L. E. AU - Perelson, A. S. PY - 2002 DA - 2002// TI - Modeling the effects of vaccination on chronically infected HIV-positive patients JO - JAIDS Journal of Acquired Immune Deficiency Syndromes VL - 31 UR - https://doi.org/10.1097/00126334-200212010-00001 DO - 10.1097/00126334-200212010-00001 ID - Jones2002 ER - TY - JOUR AU - Jones, L. AU - Perelson, A. PY - 2005 DA - 2005// TI - Opportunistic infection as a cause of transient viremia in chronically infected HIV patients under treatment with HAART JO - Bulletin of Mathematical Biology VL - 67 UR - https://doi.org/10.1016/j.bulm.2005.01.006 DO - 10.1016/j.bulm.2005.01.006 ID - Jones2005 ER - TY - JOUR AU - Perelson, A. S. AU - Kirschner, D. E. AU - De Boer, R. PY - 1993 DA - 1993// TI - Dynamics of HIV infection of CD4+ T cells JO - Mathematical Biosciences VL - 114 UR - https://doi.org/10.1016/0025-5564(93)90043-A DO - 10.1016/0025-5564(93)90043-A ID - Perelson1993 ER - TY - JOUR AU - Abu-Raddad, L. J. AU - Patnaik, P. AU - Kublin, J. G. PY - 2006 DA - 2006// TI - Dual infection with HIV and malaria fuels the spread of both diseases in sub-Saharan Africa JO - Science VL - 314 UR - https://doi.org/10.1126/science.1132338 DO - 10.1126/science.1132338 ID - Abu-Raddad2006 ER - TY - JOUR AU - Rockhill, B. AU - Newman, B. AU - Weinberg, C. PY - 1998 DA - 1998// TI - Use and misuse of population attributable fractions JO - American Journal of Public Health VL - 88 UR - https://doi.org/10.2105/AJPH.88.1.15 DO - 10.2105/AJPH.88.1.15 ID - Rockhill1998 ER - TY - JOUR AU - Levine, B. PY - 2007 DA - 2007// TI - What does the population attributable fraction mean? JO - Preventing chronic disease VL - 4 ID - Levine2007 ER - TY - JOUR AU - Van geertruyden, J. -. P. AU - D'Alessandro, U. PY - 2007 DA - 2007// TI - Malaria and HIV: a silent alliance JO - Trends in Parasitology VL - 23 UR - https://doi.org/10.1016/j.pt.2007.08.006 DO - 10.1016/j.pt.2007.08.006 ID - Van geertruyden2007 ER - TY - JOUR AU - Geertruyden, J. -. P. V. AU - Mulenga, M. AU - Kasongo, W. AU - Polman, K. AU - Colebunders, R. AU - Kestens, L. AU - D'Alessandro, U. PY - 2006 DA - 2006// TI - CD4 T-Cell count and HIV-1 infection in adults with Uncomplicated Malaria JO - JAIDS Journal of Acquired Immune Deficiency Syndromes VL - 43 UR - https://doi.org/10.1097/01.qai.0000243125.98024.da DO - 10.1097/01.qai.0000243125.98024.da ID - Geertruyden2006 ER - TY - JOUR AU - Kublin, J. G. AU - Patnaik, P. AU - Jere, C. S. AU - Miller, W. C. AU - Hoffman, I. F. AU - Chimbiya, N. AU - Pendame, R. AU - Taylor, T. E. AU - Molyneux, M. E. PY - 2005 DA - 2005// TI - Effect of Plasmodium falciparum malaria on concentration of HIV-1-RNA in the blood of adults in rural Malawi: a prospective cohort study JO - Lancet VL - 365 ID - Kublin2005 ER - TY - JOUR AU - Wyler, D. J. PY - 1976 DA - 1976// TI - Peripheral lymphocyte subpopulations in human falciparum malaria JO - Clinical & Experimental Immunology VL - 23 ID - Wyler1976 ER - TY - JOUR AU - Chougnet, C. AU - Tallet, S. AU - Ringwald, P. AU - Deloron, P. PY - 1992 DA - 1992// TI - Kinetics of lymphocyte subsets from peripheral blood during a Plasmodium falciparum malaria attack JO - Clinical & Experimental Immunology VL - 90 UR - https://doi.org/10.1111/j.1365-2249.1992.tb05859.x DO - 10.1111/j.1365-2249.1992.tb05859.x ID - Chougnet1992 ER - TY - JOUR AU - Copeland, K. F. AU - Heeney, J. L. PY - 1996 DA - 1996// TI - T helper cell activation and human retroviral pathogenesis JO - Microbiological reviews VL - 60 ID - Copeland1996 ER - TY - JOUR AU - Pisel, T. AU - Hoffman, I. AU - Jere, C. PY - 2002 DA - 2002// TI - Immune activation and induction of HIV-1 replication within CD14 macrophages during acute Plasmodium falciparum malaria coinfection JO - AIDS VL - 16 UR - https://doi.org/10.1097/00002030-200207260-00007 DO - 10.1097/00002030-200207260-00007 ID - Pisel2002 ER - TY - JOUR AU - Graham, A. L. AU - Cattadori, I. M. AU - Lloyd-Smith, J. O. AU - Ferrari, M. J. AU - Bjørnstad, O. N. PY - 2007 DA - 2007// TI - Transmission consequences of coinfection: cytokines writ large? JO - Trends in Parasitology VL - 23 UR - https://doi.org/10.1016/j.pt.2007.04.005 DO - 10.1016/j.pt.2007.04.005 ID - Graham2007 ER - TY - JOUR AU - Kedzierska, K. AU - Crowe, S. AU - Turville, S. AU - Cunningham, A. PY - 2003 DA - 2003// TI - The influence of cytokines, chemokines and their receptors on HIV-1 replication in monocytes and macrophages JO - Rev Med Virol VL - 13 UR - https://doi.org/10.1002/rmv.369 DO - 10.1002/rmv.369 ID - Kedzierska2003 ER - TY - JOUR AU - Vicenzi, E. AU - Biswas, P. AU - Mengozzi, M. AU - Poli, G. PY - 1997 DA - 1997// TI - Role of pro-inflammatory cytokines and beta-chemokines in controlling HIV replication JO - J Leukocyte Biol VL - 62 ID - Vicenzi1997 ER - TY - JOUR AU - McClelland, R. S. AU - Wang, C. C. AU - Overbaugh, J. AU - Richardson, B. A. AU - Corey, L. AU - Ashley, R. L. AU - Mandaliya, K. AU - Ndinya-Achola, J. AU - Bwayo, J. J. AU - Kreiss, J. K. PY - 2002 DA - 2002// TI - Association between cervical shedding of herpes simplex virus and HIV-1 JO - AIDS VL - 16 UR - https://doi.org/10.1097/00002030-200212060-00007 DO - 10.1097/00002030-200212060-00007 ID - McClelland2002 ER - TY - JOUR AU - Hemelaar, J. AU - Gouws, E. AU - Ghys, P. D. AU - Osmanov, S. PY - 2006 DA - 2006// TI - Global and regional distribution of HIV-1 genetic subtypes and recombinants in 2004 JO - AIDS VL - 20 UR - https://doi.org/10.1097/01.aids.0000247564.73009.bc DO - 10.1097/01.aids.0000247564.73009.bc ID - Hemelaar2006 ER - TY - JOUR AU - Thomson, M. M. AU - Perez-Alvarez, L. AU - Najera, R. PY - 2002 DA - 2002// TI - Molecular epidemiology of HIV-1 genetic forms and its significance for vaccine development and therapy JO - Lancet Infectious Diseases VL - 2 UR - https://doi.org/10.1016/S1473-3099(02)00343-2 DO - 10.1016/S1473-3099(02)00343-2 ID - Thomson2002 ER - TY - JOUR AU - Morison, L. AU - Buve, A. AU - Zekeng, L. AU - Heyndrickx, L. AU - Anagonou, S. AU - Musonda, R. AU - Kahindo, M. AU - Weiss, H. A. AU - Hayes, R. J. AU - Laga, M. PY - 2001 DA - 2001// TI - HIV-1 subtypes and the HIV epidemics in four cities in sub-Saharan Africa JO - AIDS VL - 15 UR - https://doi.org/10.1097/00002030-200108004-00012 DO - 10.1097/00002030-200108004-00012 ID - Morison2001 ER - TY - JOUR AU - Leslie, A. J. AU - Pfafferott, K. J. AU - Chetty, P. AU - Draenert, R. AU - Addo, M. M. AU - Feeney, M. AU - Tang, Y. AU - Holmes, E. C. AU - Allen, T. AU - Prado, J. G. PY - 2004 DA - 2004// TI - HIV evolution: CTL escape mutation and reversion after transmission JO - Nat Med VL - 10 UR - https://doi.org/10.1038/nm992 DO - 10.1038/nm992 ID - Leslie2004 ER - TY - JOUR AU - Fraser, C. AU - Hollingsworth, T. D. AU - Chapman, R. AU - de Wolf, F. AU - Hanage, W. P. PY - 2007 DA - 2007// TI - Variation in HIV-1 set-point viral load: Epidemiological analysis and an evolutionary hypothesis JO - Proceedings of the National Academy of Sciences VL - 104 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.0708559104 DO - 10.1073/pnas.0708559104 ID - Fraser2007 ER - TY - JOUR AU - Shirreff, G. AU - Pellis, L. AU - Laeyendecker, O. AU - Fraser, C. PY - 2011 DA - 2011// TI - Transmission selects for HIV-1 strains of intermediate virulence: a modelling approach JO - PLoS Comput Biol VL - 7 UR - https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1002185 DO - 10.1371/journal.pcbi.1002185 ID - Shirreff2011 ER - TY - JOUR PY - 1998 DA - 1998// JO - Parasitology VL - 117 UR - https://doi.org/10.1017/S0031182098003230 DO - 10.1017/S0031182098003230 ID - ref79 ER - TY - JOUR AU - Perelson, A. S. AU - Kirschner, D. E. AU - De Boer, R. PY - 1993 DA - 1993// TI - Dynamics of HIV infection of CD4+ T cells JO - Math Biosci VL - 114 UR - https://doi.org/10.1016/0025-5564(93)90043-A DO - 10.1016/0025-5564(93)90043-A ID - Perelson1993 ER - TY - JOUR AU - Mohri, H. AU - Bonhoeffer, S. AU - Monard, S. AU - Perelson, A. S. AU - Ho, D. D. PY - 1998 DA - 1998// TI - Rapid turnover of T lymphocytes in SIV-infected Rhesus macaques JO - Science VL - 279 UR - https://doi.org/10.1126/science.279.5354.1223 DO - 10.1126/science.279.5354.1223 ID - Mohri1998 ER - TY - JOUR AU - Ramratnam, B. AU - Bonhoeffer, S. AU - Binley, J. AU - Hurley, A. AU - Zhang, L. AU - Mittler, J. E. AU - Markowitz, M. AU - Moore, J. P. AU - Perelson, A. S. AU - Ho, D. D. PY - 1999 DA - 1999// TI - Rapid production and clearance of HIV-1 and hepatitis C virus assessed by large volume plasma apheresis JO - The Lancet VL - 354 UR - https://doi.org/10.1016/S0140-6736(99)02035-8 DO - 10.1016/S0140-6736(99)02035-8 ID - Ramratnam1999 ER - TY - JOUR AU - Wawer, M. J. AU - Gray, R. H. AU - Sewankambo, N. K. AU - Serwadda, D. AU - LI, X. B. AU - Laeyendecker, O. AU - Kiwanuka, N. AU - Kigozi, G. AU - Kiddugavu, M. AU - Lutalo, T. PY - 2005 DA - 2005// TI - Rates of HIV-1 transmission per coital act, by stage of HIV-1 infection, in Rakai, Uganda JO - Journal of Infectious Diseases VL - 191 UR - https://doi.org/10.1086/429411 DO - 10.1086/429411 ID - Wawer2005 ER - TY - JOUR AU - Garnett, G. P. AU - Anderson, R. M. PY - 1993 DA - 1993// TI - Factors controlling the spread of hiv in heterosexual communities in developing countries: patterns of mixing between different age and sexual activity classes JO - Philosophical Transactions: Biological Sciences VL - 342 UR - https://doi.org/10.1098/rstb.1993.0143 DO - 10.1098/rstb.1993.0143 ID - Garnett1993 ER - TY - JOUR AU - Hollingsworth, T. D. AU - Anderson, R. M. AU - Fraser, C. PY - 2008 DA - 2008// TI - HIV-1 transmission, by stage of infection JO - Journal of Infectious Diseases VL - 198 UR - https://doi.org/10.1086/590501 DO - 10.1086/590501 ID - Hollingsworth2008 ER - TY - JOUR AU - Pinkerton, S. PY - 2008 DA - 2008// TI - Probability of HIV transmission during acute infection in Rakai, Uganda JO - AIDS and Behavior VL - 12 UR - https://doi.org/10.1007/s10461-007-9329-1 DO - 10.1007/s10461-007-9329-1 ID - Pinkerton2008 ER - TY - JOUR AU - Todd, J. AU - Glynn, J. R. AU - Marston, M. AU - Lutalo, T. AU - Biraro, S. AU - Mwita, W. AU - Suriyanon, V. AU - Rangsin, R. AU - Nelson, K. E. AU - Sonnenberg, P. PY - 2007 DA - 2007// TI - Time from HIV seroconversion to death: a collaborative analysis of eight studies in six low and middle-income countries before highly active antiretroviral therapy JO - AIDS VL - 21 UR - https://doi.org/10.1097/01.aids.0000299411.75269.e8 DO - 10.1097/01.aids.0000299411.75269.e8 ID - Todd2007 ER - TY - JOUR AU - Ferry, B. AU - Caraël, M. AU - Buvé, A. AU - Auvert, B. AU - Laourou, M. AU - Kanhonou, L. AU - de Loenzien, M. AU - Akam, E. AU - Chege, J. AU - Kaona, F. PY - 2001 DA - 2001// TI - Cities ftSGoHoHEiA: Comparison of key parameters of sexual behaviour in four African urban populations with different levels of HIV infection JO - AIDS VL - 15 UR - https://doi.org/10.1097/00002030-200108004-00005 DO - 10.1097/00002030-200108004-00005 ID - Ferry2001 ER - TY - JOUR AU - Morison, L. AU - Weiss, H. A. AU - Buvé, A. AU - Caraël, M. AU - Abega, S. -. C. AU - Kaona, F. AU - Kanhonou, L. AU - Chege, J. AU - Hayes, R. J. PY - 2001 DA - 2001// TI - Cities ftSGoHoHEiA: Commercial sex and the spread of HIV in four cities in sub-Saharan Africa JO - AIDS VL - 15 UR - https://doi.org/10.1097/00002030-200108004-00007 DO - 10.1097/00002030-200108004-00007 ID - Morison2001 ER - TY - JOUR AU - Buve, A. AU - Weiss, H. A. AU - Laga, M. AU - Van Dyck, E. AU - Musonda, R. AU - Zekeng, L. AU - Kahindo, M. AU - Anagonou, S. AU - Morison, L. AU - Robinson, N. J. PY - 2001 DA - 2001// TI - The epidemiology of gonorrhoea, chlamydial infection and syphilis in four African cities JO - Aids VL - 15 UR - https://doi.org/10.1097/00002030-200108004-00009 DO - 10.1097/00002030-200108004-00009 ID - Buve2001 ER -