Skip to main content

Table 4 Parameters estimated by statistics of the trinucleotides NpCpG and CpGpM

From: Methylation-driven model for analysis of dinucleotide evolution in genomes

 

PA

PC

PG

PT

P’A

P’C

P’G

P’T

Bos Taurus (cattle)

0.2804

0.2590

0.2075

0.2531

0.2525

0.2072

0.2588

0.2815

Canis lupus familiaris (dog)

0.2654

0.2857

0.2128

0.2361

0.2360

0.2127

0.2856

0.2657

Gallus gallus (chicken)

0.3397

0.2284

0.2161

0.2158

0.2157

0.2166

0.2281

0.3396

Pan troglodytes (chimpanzee)

0.2683

0.2679

0.2285

0.2353

0.2349

0.2286

0.2675

0.2690

Danio rerio (zebrafish)

0.2887

0.2092

0.2523

0.2497

0.2498

0.2527

0.2096

0.2879

Homo sapiens (human)

0.2537

0.2818

0.2422

0.2223

0.2218

0.2420

0.2818

0.2544

Mus musculus (house mouse)

0.2856

0.2606

0.2053

0.2485

0.2483

0.2052

0.2605

0.2860

Papio anubis (olive baboon)

0.2553

0.2837

0.2384

0.2226

0.2224

0.2386

0.2837

0.2554

Ovis aries (sheep)

0.2778

0.2598

0.2150

0.2474

0.2466

0.2148

0.2595

0.2790

Sus scrofa (pig)

0.2663

0.2838

0.2137

0.2361

0.2356

0.2135

0.2840

0.2668

  1. Note: Only the autosomes of each genome were included in the statistical analyses